translation elongation rate measurement of epstein-barr virus strain gd1

[ ' e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s ' , ' g e n e e x p r e s s i o n ' , ' c o d o n u s a g e b i a s p l e a s e c i t e t h i s a r t i c l e a s ' , ' m o t a l l e b g . t r a n s l a t i o n e l o n g a t i o n r a t e m e a s u r e m e n t o f e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s s t r a i n g d 1 . i r a n j c a n c e r p r e v . 2 0 1 3 ' , ' 6 ( 4 ) ' , 2 1 4 , ' 2 1 . r e f e r e n c e s 1 . s h a r p p m ' , ' l i w h . t h e c o d o n a d a p t a t i o n i n d e x ' , ' a m e a s u r e o f d i r e c t i o n a l s y n o n y m o u s c o d o n u s a g e b i a s ' , ' a n d i t s p o t e n t i a l a p p l i c a t i o n s . n u c l e i c a c i d s r e s . 1 9 8 7 ' , 1 5 , 1 2 8 1 , ' 9 5 . 2 . g o e t z r m ' , ' f u g l s a n g a . c o r r e l a t i o n o f c o d o n b i a s m e a s u r e s w i t h m r n a l e v e l s ' , ' a n a l y s i s o f t r a n s c r i p t o m e d a t a f r o m e s c h e r i c h i a c o l i . b i o c h e m b i o p h y s r e s c o m m u n . 2 0 0 5 ' , ' 3 2 7 ( 1 ) ' , 4 , ' 7 . 3 . w u g ' , ' c u l l e y d e ' , ' z h a n g w . p r e d i c t e d h i g h l y e x p r e s s e d g e n e s i n t h e g e n o m e s o f s t r e p t o m y c e s c o e l i c o l o r a n d s t r e p t o m y c e s a v e r m i t i l i s a n d t h e i m p l i c a t i o n s f o r t h e i r m e t a b o l i s m . m i c r o b i o l o g y . 2 0 0 5 ' , ' 1 5 1 ( 7 ) ' , 2 1 7 5 , ' 8 7 . 4 . w u g ' , ' n i e l ' , ' z h a n g w . p r e d i c t e d h i g h l y e x p r e s s e d g e n e s i n n o c a r d i a f a r c i n i c a a n d t h e i m p l i c a t i o n f o r i t s p r i m a r y m e t a b o l i s m a n d n o c a r d i a l v i r u l e n c e . a n t o n i e v a n l e e u w e n h o e k . 2 0 0 6 ' , ' 8 9 ( 1 ) ' , 1 3 5 , ' 4 6 . 5 . p u i g b o p ' , ' g u z m a n e ' , ' r o m e u a ' , ' g a r c i a ' , ' v a l l v e s . o p t i m i z e r ' , ' a w e b s e r v e r f o r o p t i m i z i n g t h e c o d o n u s a g e o f d n a s e q u e n c e s . n u c l e i c a c i d s r e s . 2 0 0 7 ' , 3 5 , ' w 1 2 6 ' , ' w 1 3 1 . 6 . l a w r e n c e j g ' , ' o c h m a n h . m o l e c u l a r a r c h a e l o g y o f t h e e s c h e r i c h i a c o l i g e n o m e . p r o c n a t l a c a d s c i u s a . 1 9 9 8 ' , ' 9 5 ( 1 6 ) ' , 9 4 1 3 , ' 1 7 . x a 0 7 . g a r c i a ' , ' v a l l v e s ' , ' p a l a u j ' , ' r o m e u a . h o r i z o n t a l g e n e t r a n s f e r i n g l y c o s y l h y d r o l a s e s i n f e r r e d f r o m c o d o n u s a g e i n e s c h e r i c h i a c o l i a n d b a c i l l u s s u b t i l i s . m o l b i o l e v o l . 1 9 9 9 ' , ' 1 6 ( 9 ) ' , 1 1 2 5 , ' 3 4 . 8 . g a r c i a ' , ' v a l l v e s ' , ' g u z m a n e ' , ' m o n t e r o m a ' , ' r o m e u a . g t ' , ' d b ' , ' a d a t a b a s e o f p u t a t i v e h o r i z o n t a l l y t r a n s f e r r e d g e n e s i n p r o k a r y o t i c c o m p l e t e g e n o m e s . n u c l e i c a c i d s r e s . 2 0 0 3 ' , 3 1 , 1 8 7 , ' 9 . 9 . c a r b o n e a ' , ' z i n o v y e v a ' , ' k e p e s f . c o d o n a d a p t a t i o n i n d e x a s a m e a s u r e o f d o m i n a t i n g c o d o n b i a s . b i o i n f o r m a t i c s . 2 0 0 3 ' , ' 1 9 ( 1 6 ) ' , 2 0 0 5 , ' 1 5 . 1 0 . w i l l e n b r o c k h ' , ' f r i i s c ' , ' j u n c k e r a s ' , ' u s s e r y d w . a n e n v i r o n m e n t a l s i g n a t u r e f o r 3 2 3 m i c r o b i a l g e n o m e s b a s e d o n c o d o n a d a p t a t i o n i n d i c e s . g e n o m e b i o l . 2 0 0 6 ' , ' 7 ( 1 2 ) ' , ' r 1 1 4 . 1 1 . r u i z l m ' , ' a r m e n g o l g ' , ' h a b e y c h e ' , ' o r d u z s . a t h e o r e t i c a l a n a l y s i s o f c o d o n a d a p t a t i o n i n d e x o f t h e b o o p h i l u s m i c r o p l u s b m 8 6 g e n e d i r e c t e d t o t h e o p t i m i z a t i o n o f a d n a v a c c i n e . j t h e o r b i o l . 2 0 0 6 ' , 2 3 9 , 4 4 5 , ' 9 . 1 2 . k i m y h ' , ' c h u n g j k ' , ' l e e d s ' , ' y o u n h . d e v e l o p m e n t o f a c o d o n ' , ' o p t i m i z e d s o d i u m / i o d i d e s y m p o r t e r ( n i s ) f o r a s e n s i t i v e i m a g i n g r e p o r t e r g e n e a n d a n e f f i c i e n t t h e r a p e u t i c g e n e . j n u c l m e d . 2 0 1 3 ' , ' 5 4 ( s u p p l e m e n t 2 ) ' , ' 6 5 . 1 3 . b a u e r a p ' , ' l e i k a m d ' , ' k r i n n e r s ' , ' n o t k a f ' , ' l u d w i g c ' , ' g e r n o t l a ¨ n g s t ' , ' e t a l . t h e i m p a c t o f i n t r a g e n i c c p g c o n t e n t o n g e n e e x p r e s s i o n . n u c l e i c a c i d s r e s e a r c h . 2 0 1 0 ' , ' 3 8 ( 1 2 ) ' , 3 8 9 1 , ' 9 0 8 . 1 4 . t e l l o m ' , ' s a a v e d r a j m ' , ' s p e n c e r e . a n a l y s i s o f t h e u s e o f c o d o n p a i r s i n t h e h e g e n e o f t h e i s a v i r u s s h o w s a c o r r e l a t i o n b e t w e e n b i a s i n h p r c o d o n ' , ' p a i r u s e a n d m o r t a l i t y r a t e s c a u s e d b y t h e v i r u s . v i r o l j . 2 0 1 3 ' , 1 0 , ' 1 8 0 . x a 0 1 5 . q i n h ' , ' m i n g s h u w ' , ' a n c h u n c ' , ' d e k a n g z ' , ' x i a o y u e c ' , ' r e n y o n g j i a ' , ' q i h u i e t a l . a n a l y s i s o f s y n o n y m o u s c o d o n u s a g e i n t h e n e w l y i d e n t i f i e d d p v u l 4 3 g e n e . i j e m e . 2 0 1 1 ' , ' 1 ( 5 ) ' , 3 1 , ' 4 5 . 1 6 . r i c k i n s o n a b ' , ' k i e f f e . e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s . x a 0 x a 0 i n f i e l d s v i r o l o g y x a 0 v o l u m e 2 . 4 t h e d i t i o n . e d i t e d b y ' , ' k n i p e d m ' , ' h o w l e y p m ' , ' g r i f f i n d e ' , ' l a m b r a ' , ' m a r t i n m a ' , ' r o i z m a n b ' , ' s t r a u s s e . p h i l a d e l p h i n a ' , ' l i p p i n c o t t w i l l i a m s & ' , ' w i l k i n s . 2 0 0 1 ' , 2 5 7 5 , ' 6 2 8 . 1 7 . m a g r a t h i t . x a 0 a f r i c a n b u r k i t t & ' , ' # 0 3 9 ' , ' s l y m p h o m a . h i s t o r y ' , ' b i o l o g y ' , ' c l i n i c a l f e a t u r e s ' , ' a n d t r e a t m e n t . x a 0 x a 0 a m j p e d i a t r h e m a t o l o n c o l . 1 9 9 1 ' , 1 3 , 2 2 2 , ' 4 6 . 1 8 . h a r a b u c h i y ' , ' i m a i s ' , ' w a k a s h i m a j ' , ' h i r a o m ' , ' k a t a u r a a ' , ' o s a t o t ' , ' e t a l . n a s a l t ' , ' c e l l l y m p h o m a c a u s a l l y a s s o c i a t e d w i t h e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s ' , ' c l i n i c o p a t h o l o g i c ' , ' p h e n o t y p i c ' , ' a n d g e n o t y p i c s t u d i e s . c a n c e r . 1 9 9 6 ' , 7 7 , 2 1 3 7 , ' 4 9 . 1 9 . g l a s e r s l ' , ' l i n r j ' , ' s t e w a r t s l ' , ' a m b i n d e r r f ' , ' j a r r e t t r f ' , ' b r o u s s e t p ' , ' e t a l . x a 0 e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s ' , ' a s s o c i a t e d h o d g k i n & ' , ' # 0 3 9 ' , ' s d i s e a s e ' , ' e p i d e m i o l o g i c c h a r a c t e r i s t i c s i n i n t e r n a ' , ' t i o n a l d a t a . i n t j c a n c e r . 1 9 9 7 ' , 7 0 , 3 7 5 , ' 8 2 . 2 0 . h a m i l t o n ' , ' d u t o i t s j ' , ' r a p h a e l m ' , ' a u d o u i n j ' , ' d i e b o l d j ' , ' l i s s e i ' , ' p e d e r s e n c ' , ' e t a l . i n s i t u d e m o n s t r a t i o n o f e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s s m a l l x a 0 r n a s ( e b e r 1 ) i n a c q u i r e d i m m u n o d e f i c i e n c y s y n d r o m e ' , ' r e l a t e d l y m p h o m a s ' , ' c o r r e l a ' , ' t i o n w i t h t u m o r m o r p h o l o g y a n d p r i m a r y s i t e . b l o o d . 1 9 9 3 ' , 8 2 , 6 1 9 , ' 2 4 . 2 1 . s a d j a d i a ' , ' n o u r a i e m ' , ' m o h a g h e g h i m a ' , ' m o u s a v i ' , ' j a r r a h i a ' , ' m a l e k e z a ' , ' d e h r ' , ' p a r k i n d m . x a 0 c a n c e r o c c u r r e n c e i n i r a n i n 2 0 0 2 ' , ' a n i n t e r ' , ' n a t i o n a l p e r s p e c t i v e . a s i a n p a c j c a n c e r p r e v . 2 0 0 5 ' , 6 , 3 5 9 , ' 6 3 . 2 2 . x i a x . d a t a a n a l y s i s i n m o l e c u l a r b i o l o g y a n d e v o l u t i o n . k l u w e r a c a d e m i c p u b l i s h e r s ' , ' b o s t o n ' , ' 2 0 0 1 . x i a x ' , ' x i e z . d a m b e ' , ' s o f t w a r e p a c k a g e f o r d a t a a n a l y s i s i n m o l e c u l a r b i o l o g y a n d e v o l u t i o n . j o u r n a l o f h e r e d i t y . 2 0 0 1 ' , 9 2 , 3 7 1 , ' 3 . 2 3 . x i a x . a n i m p r o v e d i m p l e m e n t a t i o n o f c o d o n a d a p t a t i o n i n d e x . e v o l b i o i n f o r m o n l i n e . 2 0 0 7 ' , 3 , 5 3 , ' 8 . 2 4 . s h a r p p m ' , ' t u o h y t m ' , ' m o s u r s k i k r . c o d o n u s a g e i n y e a s t ' , ' c l u s t e r a n a l y s i s c l e a r l y d i f f e r e n t i a t e s h i g h l y a n d l o w l y e x p r e s s e d g e n e s . n u c l e i c a c i d s r e s . 1 9 8 6 ' , ' 1 4 ( 1 3 ) ' , 5 1 2 5 , ' 4 3 . 2 5 . s h a r p p m ' , ' l i w h . t h e c o d o n a d a p t a t i o n i n d e x ' , ' a m e a s u r e o f d i r e c t i o n a l s y n o n y m o u s c o d o n u s a g e b i a s ' , ' a n d i t s p o t e n t i a l a p p l i c a t i o n s . n u c l e i c a c i d s r e s . 1 9 8 7 ' , ' 1 5 ( 3 ) ' , 1 2 8 1 , ' 9 5 . 2 6 . k n i p e d m ' , ' h o w l e y p m ' , ' r i c k i n s o n a b ' , ' k i e f f e . e p s t e i n – b a r r v i r u s . i n ( e d s . ) ' , ' f i e l d s v i r o l o g y l i p p i n c o t t w i l l i a m s a n d w i l k i n s ' , ' p h i l a d e l p h i a . 2 0 0 1 ' , ' p p . x a 0 2 5 7 5 ' , ' 6 2 7 . 2 7 . x i a x . b i o i n f o r m a t i c s a n d t h e c e l l ' , ' m o d e r n c o m p u t a t i o n a l a p p r o a c h e s i n g e n o m i c s ' , ' p r o t e o m i c s a n d t r a n s c r i p t o m i c s . n e w y o r k ' , ' s p r i n g e r u s ' , ' 2 0 0 7 . 2 8 . z h a o l ' , ' c h e n g a ' , ' w a n g m ' , ' y u a n g ' , ' c a i m . c h a r a c t e r i z a t i o n o f c o d o n u s a g e b i a s i n t h e d u t p a s e g e n e o f d u c k e n t e r i t i s v i r u s . p r o g r e s s i n n a t u r a l s c i e n c e . 2 0 0 8 ' , 1 8 , 1 0 6 9 , ' 7 6 . 2 9 . k a r l i n s ' , ' b l a i s d e l l b e ' , ' s c h a c h t e l g a . c o n t r a s t s i n c o d o n u s a g e o f l a t e n t v e r s u s p r o d u c t i v e g e n e s o f e p s t e i n ' , ' b a r r v i r u s ' , ' d a t a a n d h y p o t h e s e s . j v i r o l . 1 9 9 0 ' , ' 6 4 ( 9 ) ' , 4 2 6 4 , ' 7 3 . ' ]